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2022/09/21阅读:8主题:科技蓝

单细胞在线课程分享

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1. 导读

​ 本文主要分享哈弗大学的单细胞数据分析课程[1],该课程提供了实验设计,表达矩阵生成,QC指标评估,细胞聚类分析等课程以供学习。

2. 学习目标

  • 了解设计单细胞 RNA-seq 实验时的注意事项
  • 讨论获取原始单细胞 RNA 测序数据和生成计数(基因表达)矩阵所涉及的步骤
  • 在工作流程的每一步计算和评估 QC 指标
  • 根据表达数据对细胞进行聚类并得出存在的不同细胞类型的身份
  • 不同样品和条件下的整合

3. 课程安排

3.1. Part 1

  1. scRNA-seq 简介
  2. 表达矩阵生成

3.2. Part 2

  1. 质量控制设置
  2. 质量控制
  3. 聚类工作流程概述
  4. 归一化理论和 PCA
  5. 标准化

3.3. Part 3

  1. 整合
  2. 聚类
  3. 聚类质量控制
  4. Marker 鉴定

更多免费课程

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参考资料

[1]

课程网址: https://hbctraining.github.io/scRNA-seq_online/schedule/links-to-lessons.html

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其他

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