文章发表：2022年，4个单细胞样本，13.5分

写这篇博客的时候，我特意在简书翻了翻自己两年半以前发表第一篇文章时的笔记，https://www.jianshu.com/p/41c560b877e8

四年前在深圳实习的点滴，又浮现在脑海。

我公众号的头像，其实是那篇文章的一个figure。当时我主要用Perl，这幅图是用Circos画的，太古早了。

回到这篇文章，和dq的合作还算顺利、愉快。我们能用4个样本，发在领域顶刊，可以说很不容易。投稿过程很折磨人，5个审稿人、来回修了6轮、耗时10个月，也难怪国人文章占比不到0.5%（"IF查与投"数据）。这个课题也投入了我过去一年半的主要科研精力，收获很大。剩下的不多的读博日子依然要继续加油！

最开始，dq是因为“公司给的结果没一张图能用”才找到我合作，我们用邮件这种传统的方式传结果，来回50封邮件，课题差不多就结束了。

dq毕业后，来到北京求学，现在博士普遍难申请，希望他能顺利申请到。

当时课题接近尾声的时候，匆匆忙忙学shiny，画了一周时间上线了在线网页，现在看来还是不错。

一个展示页，一个注释页。

入门教程跟的B站生信技能树的"shiny网页工具"，课程很不错。

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关于这篇文章用到的分析，我的公众号没有分享过的，有以下几个：

• 单细胞TCR数据分析
• 单细胞转录因子分析
• Cellchat细胞互作分析
• RNA速率分析
• 基于SNP区分scRNA-seq混测样本
• 单细胞转录组label transfer

等我有时间可以总结分享出来。