小杜的生信笔记

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2023/02/26阅读:24主题:雁栖湖

WGCNA分析 | 全流程代码分享 | 代码三

是小杜好友的可以直接和小杜索要源代码和实例数据,我希望的是:交流(Communication)!!欢迎来扰!!不要客气,要不你的加友费浪费了哦!

关于WGCNA的分析,共有3期教程,今天是的第三期。前面两期是使用代码进行分析的,也是我们的平时最常用的分析方法,对我个人来说也是最简洁的方法。(PS:对于使用代码分析,个人有个人的看法。如果你看得懂代码,那么是非常方便的;但是,一旦你遇到超出你能力范围的代码,那么这就是你噩梦


WGCNA分析教程一 [WGCNA分析教程二]((https://mp.weixin.qq.com/s/Ln9TP74nzWhtvt7obaMp1A)

我们的前面两个教程是付费教程,对于这个价格是否值得,就是仁者见仁,智者见智

上面的教程,所有代码都原封不动的附上,只需改动几个参数就可以;如果,你连需要改那几个参数都不知道,那么请看我每个教程的视频解析;那么,仍然不知道,那么你就付费咨询解决吧!!


今天的教程是来自TBtools | 零基础掌握WGCNA共表达网络分析 - 「WGCNAshiny by Warlock」,作者已经提供了详细的使用教程,也是非常方便的。直接按照作者的操作分析即可。你考虑的问题,作者大佬都给你考虑到了!! 具体请自己详细看一下。

作者代码存放位置:在GitHub中(https://github.com/ShawnWx2019/WGCNA-shinyApp


1自己使用作者教程安装时遇到的问题

我们在TBtools使用WGCNA shiny插件,启动后会进行安装相关的包,但是也许我的环境问题,一直安装不上,出现报错的情况。 当你遇到这样的情况,我们最好的解决办法就是直接使用作者的代码在Rstudio中的运行即可,运行成功后直接跳出可视化操作框。

2运行成功后的界面

那么后的操作就按作者的教程进行即可TBtools | 零基础掌握WGCNA共表达网络分析 - 「WGCNAshiny by Warlock」但是,很多的操作还是需要自己来摸索。


前面WGNCA的教程:

WGCNA分析 | 全流程分析代码 | 代码一

WGCNA分析 | 全流程分析代码 | 代码二


3ENDING

这就是本次WGNCA的系列教程,如果你感新兴趣的话,直接跳到相关的链接上。

声明:关于WGCNA的系列教程,前面两个都是的付费的。但是,如果,你是小杜的好友,可免费赠送一个代码(二选一)。前面的代码都是全套代码,直接出全部的结果和图形,只需要你自己更改参数即可。

小杜的生信筆記 ,主要发表或收录生物信息学的教程,以及基于R的分析和可视化(包括数据分析,图形绘制等);分享感兴趣的文献和学习资料!!

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